数据是企业最珍贵的财富之一，客户或供应商的详细资料等都是非常敏感的数据。能够盗窃企业数据的通常是公司的员工，可以通过严格设置每一个操作员的权限来防止这一问题，不让无关的操作员看到或打印这些资料，特别是关于数据备份的功能要严格限制。要做到这一点，软件必须有严格而细致的操作员授权功能。

有些进销存软件还有这样的性能：在一个基于WINDOWS NT架构的局域网中，数据可以存放在服务器内一个不共享的逻辑盘中，网络的所有操作员都无法看见这个盘，也就无法从服务器以外的电脑中复制数据了，这样只需派可靠的人保管好服务器就可以了。

另一个问题是由于电脑硬盘损坏造成数据丢失，可以通过及时备份数据或硬盘镜像法防止这种情况发生。