进销存实施的基础工作是梳理现有业务流程使之规范化、标准化，以先进的管理系统主导企业整个业务流程，重新构造各业务部门之间以及职能部门同二级单位的过程型工作关系和分工。

进销存软件的业务流程从系统观念出发，根据物流、资金流设计的，取代了旧的信息采集、汇总、统计与传递等管理统计工作。

旧的业务流程是按专业部门分工设计的，长久以来人们已习惯于按专业职能处理信息，在信息采集、信息共享方面未建立整体的管理规则。进销存的模块跨越了传统的部门界限，因此，需要企业业务从以职能划分转变为以流程优化重组。

需要许多部门甚至合作伙伴一起共享信息、协调工作，从而使成本、质量、服务和速度这些反映企业竞争能力的要素得以明显的改善或提高，以适应市场竞争的需求。大量实践表明，企业进销存只有在成功实施业务流程重组的基础上才能获得最佳经济效益。